在抗癌藥物研發(fā)領(lǐng)域,高通量篩選技術(shù)是加速先導(dǎo)化合物發(fā)現(xiàn)的核心工具。然而,傳統(tǒng)熒光標(biāo)記方法因細(xì)胞毒性、操作復(fù)雜性和數(shù)據(jù)偏差等問題,逐漸被無標(biāo)記活細(xì)胞分析技術(shù)所取代?;谟?jì)算機(jī)視覺、光聲成像與阻抗傳感的無標(biāo)記分析模型,通過實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)細(xì)胞形態(tài)、生長動(dòng)力學(xué)及死亡特征,為抗癌藥物篩選提供了高精度、高效率的解決方案。
一、技術(shù)突破:從熒光依賴到無標(biāo)記解析
傳統(tǒng)高通量篩選依賴熒光染料標(biāo)記細(xì)胞核或細(xì)胞膜,但熒光標(biāo)記存在兩大缺陷:一是染料可能干擾細(xì)胞代謝活性,導(dǎo)致假陽性結(jié)果;二是標(biāo)記過程耗時(shí)耗力,且難以長期追蹤細(xì)胞動(dòng)態(tài)變化。無標(biāo)記技術(shù)通過非侵入性手段直接獲取細(xì)胞生理信息,成為新一代篩選平臺(tái)的核心。
1. 計(jì)算機(jī)視覺與機(jī)器學(xué)習(xí)驅(qū)動(dòng)的形態(tài)學(xué)分析
比利時(shí)學(xué)者開發(fā)的OrBITS平臺(tái),通過卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)解析明視野圖像,實(shí)現(xiàn)了對(duì)類器官生長動(dòng)力學(xué)的無標(biāo)記監(jiān)測(cè)。該系統(tǒng)在96孔板中自動(dòng)識(shí)別類器官數(shù)量、面積及形態(tài)特征,結(jié)合熒光死亡標(biāo)記物(如Cytotox Green)進(jìn)行孔內(nèi)歸一化,消除實(shí)驗(yàn)變異。在肺癌類器官篩選中,OrBITS的劑量-反應(yīng)曲線與ATP檢測(cè)法(CellTiter-Glo 3D)高度一致,但能區(qū)分細(xì)胞毒性與細(xì)胞抑制反應(yīng),提供更深入的機(jī)制洞察。
2. 光聲顯微技術(shù)解析蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)變化
中紅外光聲顯微鏡(MiROM)通過檢測(cè)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)振動(dòng)信號(hào),實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞水平、實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)藥物誘導(dǎo)的蛋白折疊變化。在多發(fā)性骨髓瘤模型中,MiROM捕捉到蛋白酶體抑制劑(如硼替佐米)處理后細(xì)胞內(nèi)β-折疊結(jié)構(gòu)聚集,與臨床耐藥性高度相關(guān)。該技術(shù)僅需少量原代細(xì)胞即可完成個(gè)性化治療評(píng)估,為復(fù)發(fā)/難治性患者提供精準(zhǔn)用藥依據(jù)。
3. 阻抗傳感技術(shù)量化細(xì)胞生理功能
RTCA系統(tǒng)通過整合金微電極陣列的細(xì)胞培養(yǎng)板,實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)貼壁細(xì)胞引起的阻抗變化,生成細(xì)胞指數(shù)(Cell Index, CI)曲線。在A549肺癌細(xì)胞遷移實(shí)驗(yàn)中,RTCA動(dòng)態(tài)追蹤細(xì)胞浸潤過程,發(fā)現(xiàn)不同濃度喜樹堿處理后細(xì)胞遷移速率顯著降低,IC50值與熒光法一致,但無需標(biāo)記步驟。該技術(shù)已應(yīng)用于腫瘤細(xì)胞侵襲、藥物毒性及免疫細(xì)胞殺傷等多場(chǎng)景篩選。
二、應(yīng)用場(chǎng)景:從基礎(chǔ)研究到臨床轉(zhuǎn)化
無標(biāo)記分析模型在抗癌藥物研發(fā)中展現(xiàn)出三大核心優(yōu)勢(shì):
1. 加速先導(dǎo)化合物發(fā)現(xiàn)
中山大學(xué)團(tuán)隊(duì)利用CRISPR/Cas9文庫結(jié)合無標(biāo)記成像,篩選到TRAF6作為PD-L1關(guān)鍵調(diào)控因子,并驗(yàn)證硼替佐米對(duì)黑色素瘤肺轉(zhuǎn)移的抑制作用。該研究通過無標(biāo)記分析實(shí)現(xiàn)基因型-表型關(guān)聯(lián),將傳統(tǒng)篩選周期從數(shù)月縮短至數(shù)周。
2. 揭示藥物作用機(jī)制
哈佛大學(xué)nanoPRISM平臺(tái)結(jié)合機(jī)器學(xué)習(xí),發(fā)現(xiàn)脂基納米顆粒攝入依賴SLC46A3蛋白,為納米藥物遞送提供生物標(biāo)志物。無標(biāo)記分析通過多參數(shù)解析(如細(xì)胞形態(tài)、遷移速度、死亡模式),揭示藥物靶點(diǎn)與信號(hào)通路關(guān)聯(lián),避免“黑箱”篩選。
3. 指導(dǎo)個(gè)性化治療
MiROM技術(shù)在新診斷骨髓瘤患者中預(yù)測(cè)藥物敏感性,敏感患者細(xì)胞經(jīng)免疫調(diào)節(jié)藥物處理后β-折疊信號(hào)增強(qiáng),響應(yīng)比例達(dá)53%,而復(fù)發(fā)患者則無反應(yīng)。這種無標(biāo)記生物標(biāo)志物檢測(cè),為臨床決策提供實(shí)時(shí)、微創(chuàng)的評(píng)估手段。
三、未來展望:智能化與多模態(tài)融合
隨著AI與微納技術(shù)的融合,無標(biāo)記篩選平臺(tái)正朝著更高通量、更高分辨率方向發(fā)展。幻影流式細(xì)胞儀(VisionSort)通過結(jié)構(gòu)光激發(fā)與Ghost Cytometry算法,實(shí)現(xiàn)每小時(shí)1000萬細(xì)胞的高通量分選,同時(shí)捕獲單細(xì)胞形態(tài)波形與熒光信號(hào),支持CRISPR文庫篩選與基因-表型關(guān)聯(lián)分析。未來,無標(biāo)記技術(shù)將與單細(xì)胞測(cè)序、空間組學(xué)結(jié)合,構(gòu)建“表型-基因型-代謝組”多維度數(shù)據(jù)庫,推動(dòng)抗癌藥物研發(fā)進(jìn)入精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)時(shí)代。
無標(biāo)記活細(xì)胞分析模型通過消除標(biāo)記干擾、提升數(shù)據(jù)質(zhì)量與篩選效率,正在重塑抗癌藥物研發(fā)范式。從基礎(chǔ)研究到臨床轉(zhuǎn)化,這一技術(shù)為加速新藥上市、降低研發(fā)成本提供了關(guān)鍵工具,最終將惠及全球癌癥患者。